敷金とは、大家さんに預けておくお金です。
なぜ先に預けておくかというと、
「アパートを退去する際には、壊した箇所を直すなどの費用がかかるため」、

その貯金です。

敷金はどんなものに使われるかというと

退去時のクリーニング代（地方ルールあり）
喫煙で壁紙を交換する必要がある場合、
カビが生えているのを放置しいていて、掃除では取れない場合
物をぶつけるなどして壁に穴を開けた場合

などがよくあります。（原状回復費用といいます）

こういった場合に、
敷金として預けているお金から差引を行い、足りない分は追加で請求されます。

契約をする際には、退去時にはどんなお金がかかるのかよく確認して下さい。

複雑な精算方法をシンプルにするために、「敷引き制」をとることもあります。
これは、細かい費用請求はせず、定額制で原状回復を終わったことにする制度です。

敷金精算のトラブルも増えているようですが、
国交省のガイドラインといままでの慣習との間での食い違いが主な原因のようです。

判例も出てきていますが、あまり法律でギチギチにしても
入居審査がどんどん厳しくなるという弊害もあります。

いずれにしても、契約時にしっかりと敷金についても説明を受けて
お互い納得して契約することが大切です。